家蚕非滞育红卵突变体Re-nd突变基因的定位克隆

作者：张海燕; 吴金鑫; 张云贵; 赵萍; 林英^*

来源：昆虫学报, 2022, 65(06): 668-674.

DOI：10.16380/j.kcxb.2022.06.002

• 家蚕
• 非滞育红卵
• 标记开发
• 基因连锁分析
• 定位克隆

【目的】家蚕Bombyx mori非滞育红卵突变体Re-nd是唯一在非滞育状态下卵色呈现鲜红色的突变品种。本研究通过基因连锁分析和定位克隆的方法确定Re-nd的突变基因所在的染色体及紧密连锁位置，为后续Re-nd的功能研究及应用奠定基础。【方法】以家蚕卵色突变体Re-nd和野生型大造进行杂交，配制基因连锁分析群体材料和定位克隆群体材料；针对家蚕全染色体进行SNP标记开发，利用BC1代群体材料进行基因连锁分析，确定Re-nd的突变基因所在的染色体；针对定位的Re-nd的突变基因所在染色体进行SNP标记开发，利用BC1群体材料对Re-nd的突变基因进行定位克隆。【结果】基因连锁分析结果显示Re-nd的突变表型与第6号染色体上的SNP标记完全连锁；初步定位克隆结果显示Re-nd的突变基因位于SNP标记SNP7和SNP17之间，物理距离4.04 Mb;以SNP7和SNP17之间筛选出的6个SNP标记和25个重组个体进行精细定位克隆，结果显示Re-nd的突变基因所在的区域位于SNP10和SNP12两个SNP标记之间的nscaf2853上，物理距离949.3 kb左右。【结论】将Re-nd的突变基因定位于第6号染色体的2个SNP标记SNP10和SNP12之间，物理距离约949.3 kb。本研究为后续Re-nd突变基因的精细定位及功能应用研究奠定了基础。

• 单位
  西南大学; 四川省农业科学院植物保护研究所; 家蚕基因组生物学国家重点实验室