番茄钙调蛋白结合转录因子CAMTA家族基因的鉴定及其低温胁迫下表达模式的分析

作者：王宝强; 朱晓林; 魏小红^*; 金宝霞; 王贤; 王旺田

来源：农业生物技术学报, 2021, 29(05): 871-884.

• 番茄
• 钙调蛋白转录因子(CAMTA)
• 生物信息学
• 低温胁迫
• 表达分析

钙调素结合蛋白转录因子(calmodulin-binding transcription factor, CAMTA)在植物激素信号转导、发育调控和低温胁迫中发挥重要作用。本研究从番茄(Solanum lycopersicum)的全基因组水平鉴定CAMTA基因家族,利用生物信息学技术全面分析该家族成员的相关信息,并通过qRT-PCR检测CAMTA在低温胁迫下的表达。结果显示,番茄基因组中共鉴定出18个成员,分布在9条染色体上且存在1个片段复制基因对;系统进化分析显示,番茄CAMTA成员被聚为6类;SlCAMTA启动子区含有49个与植物激素、胁迫、光反应以及组织特异表达相关的顺式元件;蛋白质相互作用网络发现,部分番茄CAMTA蛋白与拟南芥(Arabidopsis thaliana)已知蛋白联系紧密;该家族大多数基因在各个组织中均有表达,一半以上的CAMTA基因具有分子功能且构成细胞基本组分,SlCAMTA10参与11种生物学过程;在低温胁迫下,14个SlCAMTAs显著上调表达,其中SlCAMTA02的相对表达量在12 h达到了最高(396.53),为对照的396倍。本研究为CAMTA家族基因功能的深入挖掘和番茄耐低温响应机制研究方面提供一定的参考依据。

• 单位
  甘肃农业大学; 生命科学技术学院