盐城市1例奥密克戎阳性标本刺突蛋白生物信息学分析

作者：王海燕; 姚学君; 陈国清; 张海燕; 安然; 管书慧; 李长城^*; 张红军^*

来源：江苏预防医学, 2023, 34(01): 49-73.

DOI：10.13668/j.issn.1006-9070.2023.01.012

• 奥密克戎
• 刺突蛋白
• 生物信息学

目的 应用生物信息学方法，分析新冠病毒奥密克戎阳性标本刺突蛋白(S)结构与功能，为抗病毒药物筛选和疫苗设计提供依据。方法 基于盐城市1例奥密克戎阳性标本S蛋白序列，采用生物信息学在线软件，预测分析S蛋白氨基酸组成、理化性质、糖基化修饰、二级结构和受体结合域等生物学特性。结果 该株奥密克戎阳性标本S蛋白为稳定的分泌性蛋白，存在跨膜螺旋区域、具有潜在的186个磷酸化位点、17个糖基化修饰位点和34个抗原细胞表位，蛋白质二级结构以无规则卷曲为主，发现4个有意义的保守结构域。结论 系统性分析奥密克戎毒株S蛋白结构与功能，有助于全面理解S蛋白生物信息学特征。