基于转录组和蛋白组关联研究技术筛选的低剂量电离辐射效应相关候选基因

作者：方芳; 余小玲; 牛东升; 李珏

来源：中华劳动卫生职业病杂志, 2021, 39(10).

• 辐射效应
• 职业暴露
• 蛋白组学
• 基因组学
• 差异表达基因

目的通过转录组和蛋白组数据关联分析, 筛选低剂量电离辐射效应相关基因, 为低剂量辐射效应的分子机制研究提供新思路。方法于2018年3月, 以健康人外周血为样本, 分为照射组(150 mGy)和对照组(0 mGy), 每组3个样本。提取两组样本总RNA和蛋白, 对转录组和蛋白组数据进行关联分析, 确定低剂量电离辐射效应相关表达基因, 并进行生物过程及分子功能等的分析。结果照射组和对照组差异表达的基因、蛋白数量分别为486、266个, 12个基因和蛋白关联(P<0.05)。定量蛋白和基因总体关联性低(rs=0.003 4), 变化趋势相同的差异基因和蛋白表达呈正相关(rs=0.678 6), 变化趋势相反的差异基因和蛋白表达呈负相关(rs=-0.100 0)。与差异蛋白表达趋势相同的差异基因有7个, 其中FBXO7和SNCA表达上调, ORM1、ORM2、HIST1H4J、HBZ、LYZ表达下调;表达趋势相反的基因有5个, 包括SLC4A1、BCAM、C4B2、KEL、TGM2, 均在基因水平上调, 蛋白水平下调。差异基因涉及免疫系统调节、信号转导、酶活性调节、跨膜运输、防御、转录和DNA修复等方面功能。结论转录组和蛋白组数据关联研究筛选出12个低剂量电离辐射效应相关候选基因及其对应的表达蛋白, 为深入研究低剂量辐射效应机制提供新线索。

• 单位
  北京市职业病防治研究院; 北京市化工职业病防治院