基于微卫星分子标记的凡纳滨对虾商业苗种遗传多样性分析

作者：方振朋; 孟宪红^*; 李旭鹏; 栾生; 曹家旺; 陈宝龙; 孔杰; 闫茂仓; 胡利华

来源：渔业科学进展, 2020, 41(05): 101-109.

DOI：10.19663/j.issn2095-9869.20190527004

• 凡纳滨对虾
• 商业苗种
• 微卫星
• 遗传多样性

为研究我国凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)商业苗种的遗传多样性特征,于河北、山东、广东、海南等地采集了6个有代表性的凡纳滨对虾品牌苗种,分别命名为黄骅R、东营M、广州P、广州Z、海南S和海南Z,以8个微卫星标记检测其遗传多样性。结果显示,6个品牌的凡纳滨对虾在8个位点呈现不同程度的多态性,其平均等位基因数(Na)、期望杂合度(He)、观测杂合度(Ho)和多态信息含量(PIC)分别为4.5～9.5、0.516～0.733、0.346～0.550和0.472～0.700,各品牌遗传多样性丰富程度从高到低分别为黄骅R>广州Z>广州P>海南Z>东营M>海南S。哈迪–温伯格平衡(HWE)检验显示,4.17%(2/48)的检测结果表现为显著的偏离(0.01<P<0.05),58.33%(28/48)表现为极显著偏离(P<0.01)。分子变异方差分析(AMOVA)发现,12%的变异来自品牌间,24%的变异来自品牌内个体间,其余64%的变异均来自所有品牌个体。UPGMA聚类分析结果显示,6个品牌的凡纳滨对虾聚为2个明显的分支,广州P和广州Z聚为一支,东营M、黄骅R、海南Z和海南S聚为一支。主成分分析(PCA)结果显示,各品牌凡纳滨对虾无法单独进行聚类。本研究初步分析了当前国内养殖凡纳滨对虾的遗传背景,实验结果可为凡纳滨对虾良种选育提供数据支撑。

• 单位
  中国水产科学研究院黄海水产研究所; 上海海洋大学; 生命学院