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摘要
利用HMMER、Pfam与SMART等工具，从决明（Senna tora）等不同物种中筛选获得26条PAL（苯丙氨酸解氨酶）序列，并对其进行生物信息学分析。结果表明，决明PAL基因家族的基本特征在单双子叶植物分离之前就已形成，且6个PAL成员被分为3个亚类。决明PAL基因家族成员的二级结构主要由α-螺旋和无规则卷曲组成；含有较高的Ala、Ser和Leu残基；存在16种不同的保守基序，其中motif12（含有催化关键序列Ala-Ser-Gly）在所有PAL成员中均出现；启动子区含有较多的光反应、植物激素响应与逆境胁迫响应元件。进一步的GO、转录组与Pearson分析也强化了以上分析结果，即决明PAL基因家族成员多集中在叶、茎和花等易感受光的组织，参与抗旱与抗菌等生物学过程呈现多样化的特点。以上分析结果将为决明PAL基因的后续功能研究及抗逆功能基因筛选提供理论基础。
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