2017—2021年杭州市临床和食品来源伦敦沙门菌耐药与基因组特征

作者：郑之北; 俞骅; 郑伟; 陈琦; 楼秀芹; 刘小东; 汪皓秋; 潘劲草^*

来源：中华预防医学杂志, 2023, 57(04).

• 沙门菌
• 多重耐药
• 全基因组测序
• 核心基因组多位点序列分型
• 耐药监测

目的分析2017—2021年杭州市临床和食品来源伦敦沙门菌的耐药与基因组特征。方法对2017—2021年杭州市分离的91株伦敦沙门菌进行药敏分析、PFGE分型和全基因组测序;利用测序数据对菌株进行多位点序列分型(MLST)、核心基因组多位点序列分型(cgMLST)和耐药基因识别, 并与公共数据库菌株比较进行系统发育分析。结果临床株和食品株对18种药物的耐药率差异均无统计学意义(均P>0.05), 其多重耐药率为75.8%(69/91), 以同时耐7类药物的菌株居多, 发现1株对多黏菌素E耐药且检出mcr-1.1基因的耐8类药物菌株;50.5%(46/91)的菌株对阿奇霉素耐药且检出mph(A)基因;91株伦敦沙门菌均为ST155型, 分为44种PFGE带型和82种cgMLST型别;系统发育分析显示, 大部分杭州菌株(83/91)自行聚集成簇, 簇内混杂少量来自欧洲和北美洲的人分离株以及湖北、深圳等省市的猪肉分离株;少数杭州菌株(8/91)与分离自东南亚、欧洲、北美洲的菌株进化距离较近;与临床株距离较近的主要是猪肉分离株。结论杭州市伦敦沙门菌的感染主要由ST155型菌株引起, 以本地传播为主, 同时与东南亚、欧洲、北美洲以及国内其他省市可能存在跨地传播;临床和食品来源菌株间耐药差异无显著意义, 多重耐药现象较为普遍;其临床感染可能与猪肉消费密切相关。

• 单位
  杭州市疾病预防控制中心