ID4基因表达谱的生物信息学分析

作者：卢学春; 楼方定; 朱宏丽; 范辉; 窦立萍; 杨波; 康慧媛; 于力

来源：军医进修学院学报, 2007, (02): 140-142.

• ID4基因
• 计算生物学
• 基因表达

目的:分析ID4基因在正常组织细胞和癌变组织细胞中的表达情况,为研究该基因的表达调控机制奠定基础。方法:采用生物信息学方法,利用开放性的数据库包括Gene expression omnibus(GEO)、Affymetrix基因芯片表达数据库、人类基因组数据库(GeneBank)、基因表达数据库SAGE、GeneCard、InterPro、ProtoNet、UniProt和BLOCKS。结果:ID4基因在多种神经系统肿瘤细胞中的表达高于正常脑组织(209/3,148/3,123/3,72/3,64/3,45/3);而甲状腺滤泡癌的表达要低于正常甲状腺组织(35/172);正常乳腺组织要明显低于转移乳腺癌和原发乳腺癌的表达(10/36,10/34);正常肺组织的表达高于肺腺癌(11/4)。此外,ID4基因在正常淋巴结、胚胎干细胞等细胞中也有表达。结论:生物信息学可以用来方便快捷地分析基因的表达谱;ID4基因的表达具有组织特异性。

• 单位
  第一临床医学院; 吉林大学; 解放军总医院