分离自人体肠道的副干酪乳杆菌K56和ET-22的菌株鉴定

作者：刘艺茹; 马霞; 赵婷; 刘锦浲; 于学健; 刘伟贤; 程坤; 张欣; 曹艳花; 辛迪; 冯慧军; 刘福东; 赵雯; 洪维鍊; 姚粟^*

来源：食品与发酵工业, 2022, 48(01): 62-69.

DOI：10.13995/j.cnki.11-1802/ts.026255

• 副干酪乳杆菌
• 菌株鉴定
• 全基因组测序
• 多位点序列分型
• 单核苷酸多态性

以婴儿和成人肠道来源的菌株K56和ET-22为研究对象，选取8株其他来源菌株作为参考，采用形态学、生理生化、基质辅助激光解析电离飞行时间质谱、全基因组测序、多位点序列分型分析和单核苷酸多态性(single nucleotide polymophism, SNP)分析，建立了适用于菌株K56和ET-22的鉴定方法。结果表明，菌株K56和ET-22及参考菌株的基质辅助激光解吸/电离飞行时间鉴定比对值大于2,平均核苷酸一致性值(average nucleotide identity, ANI)达到95%以上，在种水平均鉴定为副干酪乳杆菌(Lactobacillus paracasei);对副干酪乳杆菌K56、ET-22和参考菌株的1 701个共有核心基因开展基于全基因组测序的多基因序列位点分析，菌株K56和ET-22可与其他参考菌株有效区分，SNP分析表明不同培养代数间副干酪乳杆菌K56的SNP差异为103、ET-22的SNP差异为49,系统发育分析表明该方法可以有效区分副干酪乳杆菌K56、ET-22与其他参考菌株。益生菌的安全性和功能性均在菌株水平具有特异性，已成为业内新的科学共识。该研究建立的益生菌K56和ET-22菌株水平精准鉴定方法体系，对促进其在乳品行业的广泛应用具有重要意义。

• 单位
  内蒙古伊利实业集团股份有限公司; 中国食品发酵工业研究院有限公司