“三台”核桃不同成熟期果实转录组分析

作者：贺娜; 耿树香^*; 宁德鲁; 肖良俊

来源：安徽农业科学, 2020, 48(23): 165-178.

• “三台”核桃
• 成熟度
• 转录组
• 基因

以云南优良品种"三台"核桃4个不同成熟期种仁为材料,从分子水平上探索云南核桃(Juglans sigillata)种子不同成熟期种仁合成相关基因的表达模式。共有53 868条unigenes得到了注释,其中33 407条unigenes注释在Nr数据库中;31 725条unigenes注释在KEGG数据库中;Swissprot数据库中注释到19 842条unigenes;COG数据库中注释到16 655条unigenes。四大数据库共注释到33 753条unigenes,占总unigenes的62.66%。CK-vs-HT1、CK-vs-HT2、CK-vs-HT3、HT1-vs-HT2、HT1-vs-HT3、HT2-vs-HT3分别有2 417、2 703、4 166、1 256、5 347、3 283条上调表达的差异基因和9 515、12 455、9 498、1 751、3 132、1 365条下调表达的差异基因。不同时期基因差异表达富集度最高的为脂肪酸生物合成代谢通路。核桃果实在成熟中后期,油脂及蛋白大量积累,相关基因表达量增加。