基于数据库探索GPX4基因在泛癌中的潜在价值

作者：余水红; 李帆; 金耀; 马军; 王晓梅; 龚莉

来源：济宁医学院学报, 2022, 45(04): 278-288.

DOI：10.3969/j.issn.1000-9760.2022.04.012

• 泛癌
• GPX4基因
• 数据库

目的 探索介导肿瘤铁死亡过程中的关键基因GPX4在泛癌中的潜在价值。方法 采用UALCAN和TIMER数据库分析GPX4基因的mRNA表达水平；cBioPortal分析GPX4在泛癌中的基因变异情况；GEPIA分析GPX4表达与患者生存之间的关系；LinkedOmics分析靶向调控GPX4基因表达的MIR种类及KEGG通路分析；TIMER和GEPIA数据库研究GPX4基因与免疫细胞浸润的相关性及与免疫细胞标记基因的相关性。结果 GPX4基因在15种肿瘤组织中异常表达，12种癌组织中存在变异，其表达与结肠癌(COAD)、胃癌(STAD)及甲状腺癌(THCA)患者生存期相关，MIR-503及MIR-127共同正向调节COAD、STAD及THCA中GPX4的表达，14种MIR共同负向调节GPX4表达。在COAD、STAD及THCA中，GPX4参与氧化磷酸化、磷脂酰肌醇信号系统、赖氨酸退化、谷胱甘肽代谢、JAK-STAT信号通路及MicroRNAs调节等过程。在THCA中，GPX4与B细胞、CD4+ T、CD8+ T细胞及巨噬细胞浸润水平有相关性。结论 GPX4基因的表达、突变及调节与COAD、STAD及THCA的发生发展、患者的预后、肿瘤免疫有一定的相关性，为进一步研究其在泛癌中的作用奠定了基础。

• 单位
  安庆医药高等专科学校; 深圳大学; 安庆师范大学; 生命科学学院