烟草TPP基因家族鉴定及表达模式分析

作者:刘涛; 郭存; 邹宗庆; 金立权; 吴健; 文利超; 邓智超; 初雨蒙; 王凌涛; 李伟; 郭永峰
来源:中国烟草科学, 2022, 43(06): 1-8+16.
DOI:10.13496/j.issn.1007-5119.2022.06.001

摘要

海藻糖-6-磷酸磷酸酶(TPP)是植物海藻糖代谢过程的关键酶,在植物的生长发育及非生物胁迫响应过程中发挥着重要的作用。为挖掘参与烟草发育及抗逆胁迫的TPP基因家族成员,本研究通过生物信息学的方法,在普通烟草基因组中共鉴定出了15个TPP基因,其中7个TPP基因定位在染色体上。系统进化分析发现,新鉴定的烟草TPP成员可分为3个亚家族,分别为CLASS Ⅰ、CLASS Ⅱ和CLASS Ⅲ。共线性分析表明,有5个烟草Nt TPP基因分别与7个拟南芥AtTPP基因形成同源基因对。启动子分析发现,NtTPP成员的启动子上存在多种激素和非生物胁迫响应元件。表达模式分析发现,NtTPP基因表达具有一定的组织特异性,大部分NtTPP基因在根中的表达量最高,有12个NtTPP基因在干旱胁迫下表达量上调,13个NtTPP基因能够被盐胁迫显著诱导表达。这说明NtTPP基因家族成员在烟草非生物胁迫应答中发挥着重要作用。

  • 单位
    云南省烟草公司昆明市公司; 山东临沂烟草有限公司; 中国农业科学院研究生院; 中国农业科学院烟草研究所; 福建省烟草公司龙岩市公司

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