生物信息学方法对影响肺癌发生发展关键基因的初步筛选

作者：王俊龙; 石俊杰; 刘文洲; 孙宇; 周华富

来源：中国肺癌杂志, 2012, (11): 642-645.

• 肺肿瘤
• 基因富集
• Meta分析
• 关键基因
• 紧密连接通路 Lung neoplasms
• Gen ese tenrich analysis
• Meta-analysis
• Crucial gene
• Tight junction

背景与目的肺癌是最常见的恶性肿瘤之一。对于肺癌基因芯片的研究已在很多报道里提及,但是鲜有报道汇总所有的基因芯片数据来研究肺癌的共同表达通路从而挖掘出特殊的基因标记来作为治疗肺癌的靶点。本研究从肺癌相关的基因芯片数据库(GEO DataSets)中初步筛选出与肺癌发生发展有关键联系的基因与通路。方法运用基因富集(geneset enrichment analysis,GSEA)等生物信息学方法比较选择出的6套肺癌基因芯片表达谱数据,初步筛选出在转录水平上影响肺癌的通路及基因。结果用GSEA方法分析6组芯片集中所得的通路对比,上调中皆有的通路有3条;下调中皆有的通路有26条。本研究挑选共同存在于6...

• 单位
  广西医科大学第一附属医院