使用SPE软件筛选绿尾虹雉微卫星引物及其在亲缘关系鉴定上的应用

作者：王立; 李严; 岳碧松; 陈黎; 沈富军; 寇洁; 王也; 侯蓉; 张亮^*

来源：四川动物, 2022, 41(04): 371-378.

DOI：10.11984/j.issn.1000-7083.20210451

• 绿尾虹雉
• 微卫星
• SPE软件
• 多位点扩增
• 亲缘关系鉴定

圈养绿尾虹雉Lophophorus lhuysii多为一雄配多雌，但由于雄鸟更换，雌鸟产蛋期交错，且无特定产蛋位，导致亲子关系难以确认。本研究从绿尾虹雉基因组中广泛筛选微卫星位点，得到13对引物。采用微卫星PCR引物特异性鉴定程序（SPE）对引物序列进行评估，排除1例PCR产物长度相近的特殊多位点扩增。利用获得的12个微卫星标记在18份绿尾虹雉蛋壳/羽毛DNA样品中进行遗传多样性分析，同时以其中15份蛋壳样品（2018—2019年搜集）为检材，进行了亲缘（同胞）关系鉴定。结果表明，这12个微卫星标记可用于绿尾虹雉亲缘关系的鉴定，对提高小种群的维持能力，保持种群遗传多样性具有重要意义。

• 单位
  成都大熊猫繁育研究基地; 四川省濒危野生动物保护生物学重点实验室; 生命科学学院; 四川大学; 生物资源与生态环境教育部重点实验室