缺血性脑卒中m6A修饰与免疫微环境相关性分析

作者：梁天; 严雁; 朱路路; 黄小兰; 赵直; 钟清清; 廖芳萍; 温政; 龙建雄; 苏莉^*

来源：内科, 2023, 18(01): 1-26.

DOI：10.16121/j.cnki.cn45-1347/r.2023.01.01

• 缺血性脑卒中
• 6-甲基腺苷" name="keyword">N6-甲基腺苷
• 免疫微环境
• 聚类分析
• 富集分析
• 生物信息学

目的 初步探究N6-甲基腺苷(m6A)调节因子在缺血性脑卒中(IS)免疫微环境中的潜在作用与机制。方法 基于基因表达综合数据库(GEO),应用单样本基因集富集分析(ssGSEA)、一致性聚类分析和基因集富集分析(GSEA)等生物信息学方法综合分析m6A调节因子与IS免疫微环境的相关性。结果 Spearman相关分析结果显示，IGF2BP2 mRNA的表达与CD56亮自然杀伤细胞富集分数的正相关关系最强(rs=0.66),IGF2BP2 mRNA的表达与2型T辅助细胞富集分数的负相关关系最强(rs=-0.64);ELF3 mRNA的表达与TGFb家族成员富集分数的正相关关系最强(rs=0.56),ELAVL1 mRNA的表达与趋化因子富集分数的负相关关系最强(rs=-0.66)(均P<0.05)。一致性聚类分析确定了两种具有不同m6A修饰模式的IS亚型，亚型1中活化B细胞、活化CD4 T细胞、活化CD8 T细胞、效应记忆CD8 T细胞、自然杀伤T细胞和2型T辅助细胞的富集分数均高于亚型2(均P<0.05),而活化树突状细胞、CD56亮自然杀伤细胞和浆细胞样树突状细胞的富集分数均低于亚型2(均P<0.05);亚型1在白细胞介素和TCR信号通路的富集分数均高于亚型2(均P<0.05),而在TGFb家族成员和TNF家族成员的富集分数均低于亚型2(均P<0.05)。GSEA结果表明，亚型2可能与嗅觉转导、紧密连接和白细胞经内皮迁移等信号通路动态相关。结论 m6A修饰与IS免疫微环境存在相关性。

• 单位
  广西中医药大学第一附属医院; 公共卫生学院; 广西医科大学