紫花凤梨叶绿体基因组微卫星特征分析

作者：金亮^*; 葛亚英; 李小白; 詹书侠; 史杰玮; 曹群阳

来源：分子植物育种, 2022, 20(20): 6811-6817.

DOI：10.13271/j.mpb.020.006811

• 紫花凤梨
• 叶绿体基因组
• 微卫星
• cpSSR

紫花凤梨(Tillandsia cyanea)是一种空气凤梨，具有很高的观赏价值。由于其基因组信息缺乏，其分子生物学相关研究鲜有报道。为研究紫花凤梨叶绿体微卫星(cpSSR)特征，本研究分析了紫花凤梨叶绿体全基因组序列(157 602 bp)，使用MISA软件共识别出204个SSR位点，位点间平均分布距离为772.6 bp。其中cpSSR主要集中于大单拷贝区(LSC)，占SSR位点总数的64.22%。重复序列中主要以单碱基重复序列为主，占SSR位点总数的62.75%，主要由A/T碱基组成。cpSSR长度集中在8～20 bp，占95.10%，有10个cpSSR长度大于20 bp，这些cpSSR位点具有多态性的潜能。本研究结果为紫花凤梨的cpSSR引物筛选和遗传多样性等研究提供信息。