治理负荷沉重、正式治理资源匮乏以及治理规则的复合性是农村基层政府治理实践所需要面对的结构性困境。以集权化程度、专门化程度、标准化程度和常规化程度四个维度为基础,可以将农村基层政府内部的治理结构划分为M型、U型和H型结构三种。在基层政府的治理实践中存在M型、U型和H型结构相互叠加的特征;随着治理负荷、治理任务的属性及其对村庄社会配合需求的变化及外部问责体系的转变等,基层政府的内部治理结构会呈现出钟摆效应。