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摘要
目的 联合多个芯片筛选小肠克罗恩病相关致病基因，并分析其诊断效能，以便从分子水平探索疾病的调控机制。方法 通过GEO数据库检索并下载相关芯片数据集。利用GEO在线分析工具筛选差异表达的miRNA、R语言筛选差异表达的mRNA，构建miRNA-mRNA调控网络。差异表达的mRNA通过R语言进行GO富集和KEGG通路富集分析，运用String数据库构建蛋白互作网络（PPI）、Cytoscape软件筛选关键基因，应用ROC曲线进行诊断效能分析。结果 GSE102127数据集中共筛选出15个差异表达的miRNA,GSE20881、GSE75214、GSE102133数据集融合后筛选出273个差异mRNA，构建38个miRNA-mRNA调控关系对。差异mRNA GO富集在白细胞迁移、中性粒细胞迁移等生物过程；KEGG富集注释表明差异基因主要参与IL-17、肿瘤坏死因子等信号通路。Cytoscape软件的cytoHubba模块下基于“Degree”、“MCC”、“Betweenness”算法筛选排名前10的关键基因，取交集后得到IL-6、IL-1β、MMP9及ICAM14个关键基因。ROC曲线分析发现仅MMP9可用于诊断小肠克罗恩病，其P值为0.025,AUC为0.361，敏感性100%，特异性31%。结论 多芯片联合成功筛选出小肠克罗恩病致病基因，并构建了miRNA-mRNA调控网络，致病基因尚无法作为小肠克罗恩病早期诊断的分子标志物。
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单位合肥市第一人民医院; 安徽医科大学第四附属医院
