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摘要
溶质载体13(solute carrier 13, SLC13)是SLC转运蛋白超家族的重要成员,编码结构相似的跨膜蛋白,在介导转运阴离子和柠檬酸循环代谢中间体中发挥重要作用。近江牡蛎(Crassostrea ariakensis)基因家族收缩和扩张分析表明,SLC13家族显著扩张,可能与渗透压调节密切相关。为进一步探讨近江牡蛎SLC13基因家族(CarSLC13)特征及在高盐胁迫下的表达变化,本研究运用生物信息学方法对CarSLC13进行鉴定,并分析了其基因结构、染色体定位、系统进化和在急性高盐胁迫后鳃组织中的表达特征。本研究共鉴定出11个CarSLC13基因,包括1个CarSLC13A1亚家族成员, 6个CarSLC13A2亚家族成员和4个CarSLC13A5亚家族成员,其中7个家族成员蛋白的理化性质较为稳定,不稳定系数均小于40;亚细胞定位预测显示,所有CarSLC13均定位到细胞膜或内膜;染色体定位结果显示, 11个SLC13基因定位在6条染色体上,在第3号染色体上的部分基因发生了串联复制;该基因家族成员都具有钠-硫酸盐共转运蛋白跨膜结构域(PF00939),该结构域与渗透压调节功能相关;盐度为40的人工海水急性胁迫近江牡蛎0 h、6 h和12 h后,鳃组织中的CarSLC13A2和CarSLC13A5亚家族的基因整体上表现为先升高再降低的表达趋势,而CarSLC13A1亚家族基因表达量随胁迫时间的增加而降低。本研究明确了CarSLC13家族的基因特征、系统进化及对急性高盐胁迫的响应规律,丰富了双壳贝类SLC13基因家族的研究资料,为进一步探讨该家族在渗透压调节中的作用提供了参考数据。
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