海七鳃鳗(Petromyzon marinus)anoctaimin-1蛋白的生物信息学分析

作者：郭思呈; 赵丹; 杜树亮; 崔楠; 李铁松^*

来源：基因组学与应用生物学, 2020, 39(01): 11-17.

DOI：10.13417/j.gab.039.000011

• 七鳃鳗
• ANO1
• 生物信息学
• 进化树

七鳃鳗是现存的最原始的无颌类脊椎动物之一,也是连接无脊椎动物与脊椎动物的重要环节,对生物的起源与进化有很高的研究价值。anoctamin-1蛋白(ANO1)是一种重要的跨膜蛋白,与细胞内阴离子的跨膜运输相关。以海七鳃鳗为例,利用不同软件对海七鳃鳗ANO1蛋白的理化性质、结构域、蛋白结构特征、物种进化保守性以及系统进化关系进行生物信息学分析表明:海七鳃鳗ANO1的开放阅读框为2 373 bp,编码791个氨基酸,属于anoctamin蛋白家族,具有7个跨膜区;二级结构含有无规则卷曲、α螺旋和β折叠。将海七鳃鳗与其他物种的ANO1氨基酸序列进行同源比对,并构建系统进化树,以确认海七鳃鳗ANO1基因的保守性和进化地位。对ANO1基因及蛋白的生物信息学分析为ANO1基因及蛋白的相关研究提供了重要的信息基础。

• 单位
  生命科学学院; 辽宁师范大学