福建省猪圆环病毒4型PCR检测及全基因组序列分析

作者：刘建奎; 李娜; 吴熠丹; 邓小莺; 毛婉; 黄晓紫; 张焦杰; 黄夏玲; 魏春华^*

来源：动物医学进展, 2021, 42(08): 33-38.

DOI：10.16437/j.cnki.1007-5038.2021.08.006

• 猪圆环病毒4型
• 全基因组
• Cap基因
• 序列分析
• 系统发育

为了解福建省猪圆环病毒4型(PCV4)流行株的现状和遗传演化,收集了2018年-2019年福建省规模化猪场200份疑似断奶仔猪多系统衰竭综合征(PMWS)的猪组织病料或血清,通过荧光定量PCR方法进行PCV4的核酸检测。结果表明,200份检测样品中PCV4核酸阳性的有4份,检出率为2%(4/200),成功克隆了1个PCV4全基因组序列(FJ-PCV4)。FJ-PCV4的基因组全长为1 770 bp,与国内PCV4代表毒株(GenBank登录号MK948416和MK986820)核苷酸序列同源性为98.8%～99.2%,与PCV1、PCV2及PCV3代表毒株Eng-1970、AF055392、AF055394、DK1980PMWSfree、BDH、 MN2016和MO2015等的核苷酸同源性为43.3%～52.0%,而与水貂圆环病毒Mink circovirus strain SD16、Mink circovirus strain MiCV-DL13同源性为68.1%～68.2%,表明PCV4是一种不同于PCV1、PCV2和PCV3的新型圆环病毒。研究结果为PCV4的分子流行病学研究提供了基础资料。

• 单位
  生命科学学院; 龙岩学院