非洲水稻种质资源SSR指纹图谱的构建及遗传多样性分析

作者：黄瑞; 周雷; 何卫; 李三和; 陈志军; 刘凯; 闸雯俊; 杨国才; 焦春海; 游艾青

来源：分子植物育种, 2015, 13(07): 1476-1486.

DOI：10.13271/j.mpb.013.001476

• 种质资源
• 指纹图谱
• 遗传多样性分析
• 非洲

本研究利用均匀分布于水稻12条染色体上的36对SSR引物,以57份来自非洲和5份国内生产上的骨干品种为试验材料,进行遗传多样性分析和SSR指纹图谱的构建。结果表明:36对引物在供试材料中都具有多态性片段,共检测到192个等位基因,平均每位点5.3个等位基因;每个标记的多态性信息含量(PIC)为0.1810.823,平均值为0.570,从中筛选出在供试材料中多态性好、扩增稳定、杂带少且PIC比较高的18个引物为核心标记构建指纹图谱。采用非加权类平均法进行聚类分析,结果显示:62个品种在相似系数0.66处分为籼、粳两亚种类群;聚类树形图也能比较好地划分品种的地理来源。以等位位点的纯合性为指标,54个品种具有稳定的遗传基础。研究结果有助于优异水稻资源的创新利用,辅助杂交育种中的亲本选配,扩大栽培稻遗传基础进而提高产量、改良品质和抗性。

• 单位
  湖北省农业科学院粮食作物研究所; 武汉大学