小麦MYB转录因子家族的生物信息学分析

作者：黄建国; 张超群; 张驰; 卞云迪; 刘晓颖; 范宝莉; 王振英^*

来源：天津师范大学学报（自然科学版）, 2021, 41(05): 38-45.

DOI：10.19638/j.issn1671-1114.20210505

• 小麦全基因组鉴定
• MYB转录因子家族
• 基因结构
• 顺式作用元件
• 共线性分析

为了探究MYB转录因子家族在小麦生长发育过程中的作用,利用小麦全基因组数据库和生物信息学软件对小麦中的MYB转录因子家族进行全基因组鉴定,分析了基因结构、顺式作用元件以及种内和种间的共线性.共鉴定出76个MYB转录因子,其中亲缘关系较近的MYB转录因子的基因结构和保守结构域基本一致.顺式作用元件分析结果表明,小麦中MYB转录因子家族包含多个顺式作用元件,如脱落酸、赤霉素、厌氧诱导、干旱诱导等相关元件,参与激素调控、逆境响应等生长发育过程.与大麦和二穗短柄草的种间共线性分析中,发现了28个在进化上更为保守的转录因子.种内的共线性分析发现53个基因呈现家族内共线性.

• 单位
  天津师范大学; 生命科学学院