水稻LEA2家族的鉴定与表达谱分析

作者：薛亚莉; 魏晓双; 周海连; 李朝阳; 胡利华; 王令强; 张翠翠^*

来源：华中农业大学学报, 2021, 40(02): 93-102.

DOI：10.13300/j.cnki.hnlkxb.2021.02.010

• 水稻
• LEA2
• 非生物逆境胁迫
• 生物信息学
• 干旱胁迫
• 冷胁迫
• 淹水胁迫
• 盐胁迫
• 渗透胁迫

为探索水稻LEA2家族成员的特点,通过生物信息学分析从水稻基因组中鉴定出60个LEA2家族成员,它们不均匀分布于12条染色体。蛋白序列分析结果显示,LEA2家族蛋白的分子质量为16.24～49.14 ku,等电点4.7～11.7,有42个蛋白倾向于疏水;系统进化树分析显示,LEA2家族可以分成5个组,同一组的蛋白成员包含的保守基序类型基本相同;基因结构分析表明LEA2基因包含少量的内含子或者不含内含子;启动子分析表明水稻LEA2基因启动子包含大量与逆境胁迫响应、激素信号传导及生长发育有关的作用元件。根据表达谱分层聚类分析及荧光定量PCR实验发现水稻LEA2家族基因间共表达现象明显,同时发现OsLEA2-2和OsLEA2-26基因均受干旱胁迫上调表达60倍以上。

• 单位
  亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室; 广西大学; 华中农业大学