尖孢镰刀菌cox1基因的克隆与生物信息学分析

作者：田雨纯; 赵丹^*

来源：安徽农学通报(上半月刊), 2023, 29(15): 110-113.

DOI：10.16377/j.cnki.issn1007-7731.2023.15.013

• 尖孢镰刀菌
• cox1基因
• 生物信息学

尖孢镰刀菌可引起豆科、葫芦科、茄科等100多种植物发生根腐病、茎腐病、茎基腐病等病变，本试验对尖孢镰刀菌cox1基因进行克隆，并对其编码的蛋白质进行生物信息学分析，为进行感染尖孢镰刀菌的鉴定提供理论基础。结果表明，尖孢镰刀菌cox1基因大小为1 590 bp，编码530个氨基酸序列，理论等电点为8.46，具有疏水性，存在12个跨膜区域，不存在信号肽，二级结构中α-螺旋含量占比较高，为55.66%，三级结构预测结果与二级结构预测占比一致，进化上与轮枝镰刀菌位于一个分支，同源性较高。该结果为植物真菌病害的鉴定与防治提供了新线索。

• 单位
  山西农业大学信息学院