用Sleeping Beauty转座子筛选肺癌相关基因及功能研究

作者:朱祥平; 高增鸿; 马若骛; 汪瑾; 刘颖; 郭雅彬*
来源:岭南现代临床外科, 2023, 23(02): 118-134.
DOI:10.3969/j.issn.1009-976X.2023.02.005

摘要

目的 探讨睡美人(SB)转座子筛选肺癌相关基因的应用。方法 采用Sleeping Beauty转座子插入T2/Onc盒子(T2/Onc cassette)诱变人支气管上皮细胞(HBEC)的模型,挑选阳性克隆,高通量测序筛选共同插入位点(CIS)及候选基因。在非小细胞肺癌(NSCLC)细胞系NCI-H1299中验证筛选出的COL11A1基因功能,采用CCK-8细胞增殖实验等检测NCI-H1299细胞系敲低COL11A1前后的增殖能力及其对顺铂的敏感性变化,采用Transwell细胞迁移、侵袭实验比较其迁移、侵袭能力变化。结果 使用转座子筛选中通用的蒙特卡洛模拟法确定CIS,以P<0.05为界,共找到252个CIS,包括675个候选基因。结果显示,筛选出的COL11A1基因可以促进NCI-H1299细胞系增殖(P<0.01)、迁移(P<0.001)、侵袭(P<0.001)并介导其顺铂耐药(P<0.001)。结论 本研究证明了使用SB转座子插入T2/Onc诱变HBEC的模型能够很好地筛选出肺癌相关基因,并证实了COL11A1可以促进NSCLC细胞增殖、迁移、侵袭并介导顺铂耐药及上皮间质转换。

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