摘要

目的 通过生物信息学分析铁死亡通路关键基因在肝癌中的表达、预后价值,及其与免疫微环境的相关性。方法 利用GEPIA在线数据库分析铁死亡通路关键基因在肝癌中的表达;采用cBioPortal在线数据库分析肝癌患者中铁死亡通路关键基因的基因改变情况,Kaplan-Meier生存曲线分析其与肝癌患者预后的关系,采用TIMER数据库及TIDE数据库分析铁死亡通路关键基因与免疫环境的相关性。结果 通过GEPIA数据库发现ACSL4在肝癌组织中的mRNA表达量明显高于正常组织(P<0.05)。cBioPortal数据库分析显示肝癌中铁死亡通路关键基因存在基因改变,主要包括基因扩增、缺失突变、错义突变和框内突变。Kaplan-Meier生存分析显示GPX4的高表达与肝癌患者预后良好相关(PFS:HR=0.68,P=0.014);SLC7A11的高表达与肝癌患者预后差相关(OS:HR=2.41,P=5.3e-07; PFS:HR=1.79,P=0.00043)。TIMER数据库分析显示SLC7A11和Nrf2与B细胞、CD8+T淋巴细胞、CD4+T淋巴细胞、中性粒细胞、巨噬细胞和树突状细胞的浸润均呈正相关。结论 铁死亡通路关键基因与肝癌患者的预后、免疫细胞浸润存在显著相关性,是肝癌治疗的潜在靶点,具有重要的临床价值。

  • 单位
    复旦大学附属中山医院

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