不同病原微生物核酸提取方法的对比

作者:陈涛; 柴海云; 刘彦; 黄月眉; 黄伟; 张召; 林东子*
来源:广东医科大学学报, 2023, 41(06): 619-627.

摘要

目的 通过肺泡灌洗液模拟样本,比较不同提取试剂对病原微生物DNA的提取效果。方法 选择白念珠菌、金黄色葡萄球菌、表皮葡萄球菌、大肠埃希菌等代表菌,根据肺泡灌洗液细胞含量,添加特定数量的细胞及不同浓度的混合菌液,模拟临床肺泡样本。采用3种市售核酸提取试剂盒(凯杰、诺唯赞、美基)与自研优化后(南芯自研)的方法进行核酸提取,通过对核酸提取质量及PCR扩增结果对比提取效率。结果 南芯自研试剂与3个品牌各样本的A260/A280比较差异均无统计学意义(P>0.05)。当菌液浓度≥105 CFU/mL时凯杰提取核酸浓度最高,南芯自研次之(P<0.01)。4个不同样本中,3家品牌试剂处理的4种微生物的Ct值与南芯自研提取试剂比较,差异有统计学意义(P<0.01或0.05)。当菌液浓度≥104 CFU/mL时,南芯自建提取试剂对应的Ct均低于另外3种提取试剂(P<0.01或0.05)。结论 南芯自研核酸提取方法是一种性价比较高的病原微生物核酸提取法。