用VITEK 2 Compact系统鉴定准确率低的临床少见病原菌评价焦磷酸测序技术鉴定能力

作者：李继霞; 公衍文; 张月娥; 胡成进

来源：生物医学工程与临床, 2016, 20(06): 626-630.

DOI：10.13339/j.cnki.sglc.20161107.017

• 焦磷酸测序技术
• VITEK 2 Compact系统
• 16S rRNA
• 少见病原菌

目的用焦磷酸测序技术鉴定经VITEK 2 Compact系统鉴定准确率低或无法鉴定的46株细菌,对两种方法在少见菌的鉴定能力进行评价。方法选择经VITEK 2 Compact系统鉴定准确率低或无法鉴定的46株细菌(包含革兰阳性球菌、革兰阳性杆菌、革兰阴性球菌及革兰阴性杆菌),提取DNA模板,做焦磷酸测序技术分析;同步进行Sanger法测序并以其结果作为准确鉴定的"金标准"。结果焦磷酸测序技术在4 h内完成46株细菌的鉴定。焦磷酸测序技术鉴定正确率为71.74%(33/46),VITEK 2 Compact系统鉴定正确率为43.48%(20/46)。46株菌中,两种方法鉴定均鉴定正确的菌株19株;焦磷酸测序技术鉴定正确、VITEK 2 Compact系统鉴定准确率低、未鉴定或鉴定错误的菌株14株;VITEK2 Compact系统鉴定正确、焦磷酸测序技术鉴定错误的菌株1株;两种方法均鉴定错误的菌株12株。结论对于微生物实验室利用传统方法无法准确鉴定的细菌,利用焦磷酸测序技术鉴定具有准确、快速及简便的特点,可适用于临床少见病原菌的鉴定。

• 单位
  中国人民解放军济南军区总医院