《粤港澳大湾区发展规划纲要》在高等教育方面提出的支持粤港澳高校合作办学,充分发挥粤港澳高校联盟作用等措施的制度安排,实则为粤港澳大湾区高等教育整合埋下了伏笔。粤港澳高等教育整合动力既有来自国家大湾区发展战略,同时也有高等教育内部发展规律使然等因素。粤港澳高等教育整合过程应当坚持政府引导性原则、灵活性原则、人本性原则和异质性原则;大湾区高等教育整合的主要目标是塑造港澳学生的湾区认同感和国家身份认同感、提升高等教育质量、实现整体创新发展和构建高等教育新秩序。