基于分子对接技术探讨胃萎清颗粒干预慢性萎缩性胃炎“炎-癌”关键mRNA的机制

作者：潘静琳; 温舒婷; 文艺; 李培武; 刘雨丰; 符滨; 汪雪琦; 刘凤斌^*

来源：中华中医药杂志, 2019, 34(10): 4542-4546.

• 慢性萎缩性胃炎
• 炎-癌
• 关键mRNA
• 胃萎清颗粒

目的:明确慢性萎缩性胃炎"炎-癌"相关的关键mRNA,运用分子对接技术探讨胃萎清颗粒治疗慢性萎缩性胃炎的可能机制。方法:通过生物信息学技术挖掘TGCA和GEO数据库中172例临床胃黏膜样本的基因芯片数据(正常人、慢性萎缩性胃炎、胃腺癌),筛选慢性萎缩性胃炎"炎-癌"相关的mRNA。采用Cytoscape3.2.1软件中的12种算法筛选关键mRNA。以KEGG进行通路富集分析,以String数据库进行邻近蛋白互作分析。以此为关键靶点,采用SystemsDock与前期通过LC-Q-TOF-MS、GC-MS所鉴定的8个胃萎清颗粒药物组分,进行分子对接,分析药物组分与关键mRNA靶蛋白的相互作用程度。结果:筛选出慢性萎缩性胃炎"炎-癌"相关mRNA 13个,其中,CCND1为慢性萎缩性胃炎"炎-癌"相关的关键mRNA。其富集通路47条,与癌症相关通路33条,与胃癌相关通路19条,与其邻近的10个蛋白发生相互作用,产生相互作用关系41条。8个胃萎清颗粒的药物组分均与CCND1具有较好的结合活性,PKD/PKI>5。结论:CCND1可能为慢性萎缩性胃炎"炎-癌"转化的关键分子,胃萎清颗粒的8个药物组分可能通过调节CCND1的表达阻断"炎-癌"转化。

• 单位
  海南省中医院; 清远市中医院; 中山市中医院; 广州中医药大学第一附属医院