高等植物类黄酮3′5′-羟化酶基因cDNA及其氨基酸序列的生物信息学分析

作者：杨晓娜; 陈自宏^*; 陈宏艳; 谢雯颖

来源：保山学院学报, 2021, 40(02): 24-32.

• 高等植物
• 类黄酮3’5’-羟化酶基因
• cDNA序列
• 氨基酸序列
• 生物信息学分析

用生物信息学方法对GenBank中的23种高等植物的类黄酮3’5’-羟化酶基因(F3’5’H)的cDNA序列及其编码氨基酸序列的结构、理化性质、信号肽、疏水性/亲水性、亚细胞定位、跨膜结构域、功能域和进化关系进行了初步预测分析;结果表明:不同植物F3’5’H基因cDNA序列起始密码子均为ATG,终止密码子均为TAA、TAG或TGA,包括5’,3’非翻译区和一个开放阅读框;不同植物F3’5’H基因cDNA序列编码的氨基酸序列的理化性质基本一致,有3段保守序列"PPGP""AGTDT""FGAGRRICAG",不同植物F3’5’H具有三个跨膜结构域,定位于细胞质上,并有一段与细胞色素P450功能区相匹配的功能域;类黄酮3’5’-羟化酶属具转运肽的亲水性稳定分泌蛋白,α-螺旋和无规卷曲为最主要的二级结构元件,延伸链和β-转角散布于整个结构。

• 单位
  保山学院