广西柳州市丙型肝炎病毒的基因型和基因亲缘性分析

作者：尹琦; 杨庆利; 王学燕; 李海; 陈钦艳; 谭超; 罗洲

来源：中国热带医学, 2016, 16(10): 965-969.

DOI：10.13604/j.cnki.46-1064/r.2016.10.05

• 丙型肝炎病毒
• 基因型
• 亲缘性分析

目的分析近年来广西柳州市丙型肝炎病毒(HCV)的基因型和基因亲缘性。方法用巢式RT-PCR法对HCV NS5B区进行扩增,通过测序和构建进化树进行基因分型并分析基因亲缘性。结果对182株HCV基因分型:1a型占3.3%,1b型占50.5%,3a型占17.0%,3b型占4.9%,6a型占26.4%,6c/d型占2.7%,6型未分亚型(6un)占0.5%。6株1a型HCV与美国参照株属不同分支。2.2%(2/92)的1b型与日本参照株属同一分支;29.3%(27/92)的1b型与来源于上海的参照株属于同一分支,其余67.4%(62/92)的1b型则独立分支;另外1株独立于上述各分支外。95.2%(20/21)的3a型以及77.8%(7/9)的3b型与日本和澳大利亚参照株属同一分支或并列分支。4.8%(1/21)的3a型和22.2%(2/9)的3b型则独立分支。97.9%(47/48)的6a型与越南、香港和英国参照株属同一分支或并列分支;2.1%(1/48)的6a型独立于上述分支外。5株HCV与6c和6d参照株并列分支,1株6型病毒未能区分亚型。结论近年来广西柳州市HCV流行的主导基因型是1b、6a和3a。1b型的大部分具有独立的本地亲缘性特征;而6a和3a型的绝大部分则无此特征。

• 单位
  广西壮族自治区疾病预防控制中心; 柳州市柳铁中心医院