2007年6—7月、2010年8—9月两次对康龙自然保护区境内鱼类资源进行调查,利用网捕法和电捕法共采集到鱼类标本2000号,经鉴定共发现鱼类37种,隶属4目,10科。其中鲤形目2科27种,占73%,鲈形目5科7种,占18.9%,鲶形目2科2种,占5.4%,合鳃鱼目1科1种,占2.7%,调查发现康龙自然保护区的鱼类区系,具有较强的华东区系和华南区系双重特征,该区经济鱼类种类丰富,但是鱼类小型化、低龄化趋势显著,且出现衰退现象,鱼类资源需要加强保护。