中药种质资源保护是我国基本战略,国家中药种质资源库是实施资源保护研究的良好载体。本文从中药"种质"内涵的遗传物质角度,围绕国家中药种质资源库开展资源保护研究的四个核心环节,即资源收集、保存、创新与综合评价,综述了基因组学在其中的应用原理、技术,以及总结展望,为中药种质资源的可持续开发研究提供参考。