基于低秩矩阵分解方法预测miRNA与疾病的关联

作者：汪一百

来源：信息技术与信息化, 2021, (11): 129-131.

• microrna
• 低秩矩阵
• LRMCM
• 交叉验证

越来越多研究表明microRNAs(miRNAs)在疾病的治疗与诊断中充当重要的生物标记物。近年来,通过低秩矩阵补全的方法预测mirna与疾病的关联(LRMCM:a low-rank matrix completion-based method to predict miRNA-disease associations),成了生物信息学领域的一个研究热点。利用一种低秩矩阵完成的方法来预测mirna与疾病关联,首先对已知的mirna与疾病构造一个邻接矩阵,然后用mirna相似性矩阵和疾病相似性矩阵进行正则化处理。在5倍交叉验证中,方法AUC为0.880 6,在预测mirna与疾病关联方面,显著优于典型的方法。

• 单位
  长沙医学院