西农关中奶山羊PDCD4基因的克隆与组织表达分析

作者：逄国梁; 张海荣; 王战航; 朱俊儒; 安小鹏

来源：畜牧与兽医, 2022, 54(07): 1-6.

• 关中奶山羊
• PDCD4
• 生物信息学
• 组织表达

旨在研究程序性细胞死亡因子4(PDCD4)基因与奶山羊乳腺发育的关系。应用RT-PCR技术克隆PDCD4基因编码区(CDS)序列，并进行生物信息学分析，运用荧光定量PCR(qRT-PCR)技术检测不同组织mRNA相对表达量。结果表明：克隆获得的关中奶山羊PDCD4基因CDS序列长1 410 bp,编码469个氨基酸，分子质量为51.8 ku,分子式为C2245H3606N636O730S19,理论等电点为5.03;编码蛋白含有4个N-糖基化位点、6个O-糖基化位点及53个潜在的磷酸化位点；PDCD4蛋白为亲水性酸性蛋白质，无信号肽，无跨膜结构域；系统进化树显示PDCD4蛋白的氨基酸序列在不同物种间相似度较高，奶山羊与绵羊、牛、猫、猪、弯角大羚羊、美洲白尾鹿等同源性均在90%以上，其中与绵羊的亲缘关系最近；蛋白互作分析显示PDCD4蛋白能与EIF4A1、EIF4G1、PTEN、EIF4A2、EIF4B、RECK、GMPS、EEF1G等蛋白相互作用；qRT-PCR结果显示PDCD4基因在奶山羊各组织中均有表达，在乳腺组织中的表达量最高，其次为肺，在肌肉组织中几乎不表达。本研究为山羊乳腺功能的研究提供了一定的参考资料。

• 单位
  陕西省畜牧技术推广总站; 西北农林科技大学; 动物科技学院