亚麻COBRA基因家族的鉴定与生物信息学分析

作者：齐燕妮; 李闻娟; 王利民; 赵玮; 党照; 谢亚萍; 张建平^*

来源：甘肃农业科技, 2019, (09): 33-38.

• 亚麻
• 纤维
• COBRA基因家族
• 序列分析
• 系统进化分析

COBRA基因编码糖基磷脂酰肌醇锚定蛋白,是次生壁加厚和纤维素含量的调节因子。亚麻纤维为韧皮纤维,纤维产量与次生壁中纤维素含量及次生壁加厚密切相关。通过BLASTP和Pfam分析,鉴定到24个亚麻COBRA家族成员,并对其进行基因结构、蛋白理化性质及系统进化等生物信息学分析。结果表明,有22个成员具有跨膜结构域,21个成员具有N-端信号肽,16个成员具有GPI锚定位点,所有蛋白均具有CCVS保守结构域而且都定位在细胞膜。基因结构和系统进化分析表明,亚麻COBRA基因家族分为2个亚家族:COBRA-I和COBRA-II,2个亚家族的基因结构具有明显的差异。

• 单位
  甘肃省农业科学院作物研究所