金黄色葡萄球菌的药靶基因预测

作者：顾洪; 廖毅; 向小兵; 曾凡才^*

来源：青岛大学学报(医学版), 2020, 56(04): 437-443.

• 金黄色葡萄球菌
• 抗药性,细菌
• 基因组岛

目的利用生物信息学方法从基因层面筛选金黄色葡萄球菌(金葡菌)药靶基因。方法应用Zcurve、Prodigal等软件重新注释金葡菌基因组并预测到61个漏注释基因,其次列出金葡菌的必需基因170个、高表达基因185个(20～205个)及基因组岛基因32个,通过同源比对排除人类及有益肠道菌群基因,最后在DrugBank上检索核查目标药靶。结果通过反复筛选并排除肠道有益菌群后最终得到SAZ1720418、SAZ1720420、SAZ1721976、SAZ1721978、SAZ1721980、SACOL1524、SA29811507、SA29812326、SA29812521、SA29811955共10个可作为药靶的基因。结论筛选出的10个基因可对金葡菌耐药菌株的广谱抗菌药物研制提供理论帮助。

• 单位
  西南医科大学