三棱内酯B调控人冠状动脉内皮细胞基因表达谱的生物信息学分析

作者：刘天龙; 柳敏娜; 张煜; 尚沛津; 张一恺; 丁一; 刘文星; 翟小虎; 梁凌飞; 文爱东

来源：现代生物医学进展, 2017, 17(31): 6033-6144.

DOI：10.13241/j.cnki.pmb.2017.31.008

• 三棱内酯B
• 人冠状动脉内皮细胞
• 基因表达谱
• 生物信息学分析

目的:分析三棱内酯B在人冠状动脉内皮细胞中的表达谱数据集,寻找三棱内酯B调控血管内皮功能的关键作用靶点。方法:基于GEO公共数据库,下载原始表达谱数据集(GSE44598),经过差异基因筛选,功能注释,通路富集,信号通路网络以及基因互作网络分析,找出三棱内酯B对人冠状动脉内皮细胞基因表达谱产生影响的关键基因和信号通路。结果:同对照组相比,三棱内酯B给药组共有5224个基因有显著性差异,包括2628个上调基因和2596个下调基因。基因功能注释和信号通路富集分析表明,差异基因主要参与了细胞周期过程。网络分析显示,MAPK信号通路、细胞周期通路以及PLCG2,PRKACA和ADCY4等为关键信号通路和基因。结论:三棱内酯B通过影响PLCG2,PRKACA,ADCY4等基因的表达,参与MAPK和细胞周期等信号通路,从而调节人冠状内皮细胞的功能。这些关键基因和信号通路是三棱内酯B在心血管疾病治疗应用中潜在的作用靶点。

• 单位
  沈阳军区总医院; 西京医院肾脏内科; 第四军医大学