评价新型稳定同位素赖氨酸标记在定量蛋白质组学中的应用

作者：高东梅; 孙璐; 郭坤; 李岩; 刘银坤; 康晓楠

来源：生物工程学报, 2012, (07): 855-864.

DOI：10.13345/j.cjb.2012.07.010

• 稳定同位素标签
• 质谱
• 定量蛋白质组学
• 咪唑 stable isotope coding tag
• mass spectrometry
• differential proteomics
• imidazole

为了评价基于2-甲氧基-4,5-二氢-1氢-咪唑稳定同位素试剂在定量蛋白质组学中的应用价值,合成了轻型(D0)和重型(D4)的2-甲氧基-4,5-二氢-1氢-咪唑,通过对标准蛋白BSA酶解后产物的标记确认标记反应的特异性,并观察了标记物在MALDI-TOF-MS和LC-ESI-MS中定量的准确性,标记肽在串联质谱中的离子特点,以及对反相液相色谱行为的影响。结果表明,2-甲氧基-4,5-二氢-1氢-咪唑只与酶解后的肽段赖氨酸侧链氨基反应,具有良好的标记特异性;差异表达蛋白的定量可以通过MALDI和ESI电离模式实现;标记肽的串联质谱主要产生y离子,测序更为简便;反相液相色谱可以保持较好的分离效果...

• 单位
  复旦大学; 复旦大学附属中山医院