针对当前高职院校科研管理工作中存在的信息沟通效果差、工作效率低的问题,提出了基于信息化的扁平式的管理模式,分析了当前高职院校科研管理中存在的问题,阐述了开展扁平化管理的优势,从加强顶层整体规划、完善规章制度、改革科研管理人员模式和加强人才梯度建设四个方面展开分析,实践效果说明了基于扁平化管理的效果是良好的。