基于生物信息学的ECSM2胞外区B细胞表位预测

作者：勾蓝图; 杨金亮

来源：免疫学杂志, 2010, (02): 156-160.

DOI：10.13431/j.cnki.immunol.j.20100037

• ECSM2
• B细胞表位
• 生物信息学 ECSM2
• B cell epitope
• Bioinformatics

目的预测内皮细胞特异分子-2(endothelial cell-specific molecule-2,ECSM2)胞外区B细胞表位。方法以ECSM2胞外区氨基酸序列为基础,应用公共的生物信息学工具,分析ECSM2的序列特异性、二级结构,以及极性、亲水性、柔韧性、表面可及性等参数,然后借助专业的B细胞表位预测工具预测潜在的B细胞表位,最后对获得的数据综合分析,评判ECSM2胞外区最有可能的B细胞表位。结果综合分析多种生物信息学工具获得的数据表明,ECSM2胞外区69-93位氨基酸区段包含了4个相互重叠的潜在表位,具有极大的B细胞表位可能性。结论应用生物信息学预测出的ECSM2胞外区B细胞表位,...

• 单位
  生物治疗国家重点实验室; 四川大学华西医院