摘要
目的:根据分子对接技术与网络药理学初步预测出吲哚-3-甲醇作用的靶点和相关信号通路,再通过体外实验来验证网络药理学与分子对接技术得出的结果。方法:利用SwissTargetPrediction成分靶点预测数据库及查阅文献获得吲哚-3-甲醇的药理作用相关的靶点;利用人类孟德尔遗传病数据库(OMIM),基因数据库(GeneCards),毒性与基因比较数据库(CTD)数据库取得与肥胖相关的靶点;在通过STRING数据库得到吲哚-3-甲醇-肥胖靶点PPI网络图;通过Cytoscape 3.8.2软件进行筛选和分析;利用DAVID 6.8数据库对药物-疾病交集靶点进行基因本体(GO)功能注释和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。通过AutoDock vina 1.1.2软件对吲哚-3-甲醇和疾病靶点进行分子对接;最后通过体外实验验证了药物抗肥胖的作用。结果:预测结果得出吲哚-3-甲醇与肥胖共同靶点有80个,包括基质金属蛋白酶(MMP)-9,Janus激酶(JAK)2等;KEGG富集分析结果显示吲哚-3-甲醇治疗肥胖主要作用于肿瘤坏死因子(TNF)信号通路,血管内皮生长因子(VEGR)信号通路,酪氨酸激酶受体2(ErbB2),VEGF等信号通路;分子对接显示吲哚-3-甲醇与肥胖相关蛋白(FTO)受体表现出良好的对接活性;体外蛋白免疫印迹、噻唑蓝(MTT)和油红O染色结果表明,不同剂量的吲哚-3-甲醇能有效抑制3T3-L1细胞内FTO蛋白的表达(P<0.05)。结论:吲哚-3-甲醇治疗肥胖的作用机制可能与抑制FTO蛋白表达有关,进而与抑制脂肪细胞增殖能力有关。该研究为吲哚-3-甲醇抗肥胖提供了基本实验依据。
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