中国辣椒AAT基因家族的鉴定及表达分析

作者：衡周; 叶楚; 方健敏; 杨静; 徐小万; 徐晓美; 李涛; 王恒明

来源：广东农业科学, 2023, 50(11): 40-49.

DOI：10.16768/j.issn.1004-874X.2023.11.004

• 中国辣椒
• 醇酰基转移酶
• 生物信息学
• 实时荧光定量PCR
• 基因鉴定
• 表达分析

【目的】中国辣椒（Capsicum chinense）是辣椒主要栽培种之一，种内多数品种的果实呈现由支链酯类物质形成的浓郁果香。醇酰基转移酶（Alcohol acyl-CoA transferase,AAT）催化支链酯类合成的最后一步反应，对支链酯类含量有重要影响。鉴定中国辣椒中AAT基因家族成员并分析其组织表达模式，可为其功能研究提供参考。【方法】通过生物信息学分析和实时荧光定量PCR对中国辣椒的AAT基因家族进行鉴定及表达特征分析。【结果】从中国辣椒基因组中鉴定到10个AAT基因，分布于6条染色体上，分别命名为CcAAT1-10。理化性质预测结果显示，AAT基因家族编码的氨基酸序列长度在256～683 aa之间，分子质量范围为29～77 kDa，等电点范围为5.34～8.79，平均亲水系数均为负值，不稳定指数在23.76～51.02之间。蛋白质结构预测显示，CcAAT的二级结构以α-螺旋和无规则卷曲为主，三级结构差异较大。亚细胞定位预测发现CcAAT均定位于细胞质中，其基因启动子上存在16种顺式调控元件。时空表达分析显示，CcAAT5、CcAAT6在辣椒各器官中均未检测到表达，CcAAT8在花和果实中特异表达，CcAAT1、CcAAT3、CcAAT7在叶片中高表达，CcAAT4在根系中高表达。【结论】明确了中国辣椒中AAT基因家族成员和表达模式，推测CcAAT8可能是影响果实支链酯类物质含量的关键基因。

• 单位
  广东省蔬菜新技术研究重点实验室; 广东药科大学; 广东省农业科学院蔬菜研究所