敖鲁古雅驯鹿SRY基因的生物信息学分析

作者：何金明; 鞠妍; 邢秀梅; 王磊; 董依萌; 鞠贵春^*

来源：吉林农业大学学报, 2022, 44(01): 97-103.

DOI：10.13327/j.jjlau.2020.5301

• 敖鲁古雅驯鹿
• SRY基因
• cDNA序列
• 生物信息学分析
• 系统进化分析

对敖鲁古雅驯鹿SRY(Sex-determiningregion of Y-chromosome)基因的cDNA序列进行测序及初步生物信息学分析。运用RT-PCR技术从敖鲁古雅驯鹿鹿茸组织中扩增SRY基因的cDNA序列，利用生物信息学软件对敖鲁古雅驯鹿SRY基因的cDNA序列及蛋白质结构进行分析，同时构建系统发育树。结果表明：扩增的敖鲁古雅驯鹿SRY基因的cDNA序列与GenBank数据库中登录的驯鹿SRY基因的cDNA序列(登录号AB247629.1)一致，全长690 bp。敖鲁古雅驯鹿SRY基因编码229个氨基酸；敖鲁古雅驯鹿SRY蛋白无信号肽和跨膜结构；结合其二级结构和结构域预测分析，SRY蛋白的二级结构以无规则卷曲和α-螺旋为主，具有HMG结构域。通过构建NJ系统发育树，发现敖鲁古雅驯鹿与白尾鹿之间的亲缘关系相对较近。研究结果为深入探索敖鲁古雅驯鹿SRY基因的生物学功能提供了基础参考。

• 单位
  中国农业科学院特产研究所; 吉林农业大学