生物信息学软件预测猪氨基肽酶N功能与结构

作者：贾燕; 曹金山; 魏战勇^*

来源：畜牧与饲料科学, 2021, 42(02): 1-6.

• 猪氨基肽酶N
• 肠道冠状病毒
• 生物信息学软件
• 功能
• 结构

[目的]研究猪δ冠状病毒(PDCoV)入侵宿主细胞的感染机制,对其特异性受体猪氨基肽酶N基因编码蛋白功能与结构进行分析。[方法]通过多种生物信息学软件对pAPN蛋白的理化特性、亲疏水性、信号肽、跨膜区、糖基化位点、抗原表位、功能结构域及结构特征等进行预测分析。[结果]pAPN基因总长为2 892 bp,编码963个氨基酸;其中,第35～963位氨基酸为膜外蛋白区,不含信号肽但包含2个典型的功能结构域。pAPN蛋白共有23个糖基化修饰位点和42个抗原表位。pAPN蛋白胞外域空间结构为二聚体,每个单体均可分为Ⅰ～Ⅳ4个结构域。[结论]该研究为了解pAPN蛋白与多种猪肠道冠状病毒相互作用的机制提供了思路。

• 单位
  河南农业大学; 内蒙古农业大学