结核分枝杆菌Hrp1蛋白的生物信息学分析

作者：刘静; 吴芳; 张杰; 董江涛; 柳小玲; 梁粟; 王菊; 张春军; 吴江东; 章乐; 赵海军^*; 张万江^*

来源：中国人兽共患病学报, 2021, 37(08): 669-677.

DOI：10.3969/j.issn.1002-2694.2021.00.081

• 结核分枝杆菌
• Hrp1蛋白
• 生物信息学
• 结构

目的应用生物信息学预测分析Hrp1蛋白结构功能和生物学特性。方法生物信息学软件ORF Finder、SOSUI、Protpapram、ProtScale、Signal IP、Tmpred、TMHMM、NetNGlyc、NetPhos-3.1-Servera、PSORT、WoLF PSORT、TargetP-2.0-CBS、NLStradamus、SOMPA、SWISS-MODEL、IEDB、SYFPEITHI、RANKPEP、BLAST、DNAStar、STRING对Hrp1蛋白的理化性质、结构功能、生物学特性、抗原表位及蛋白相互作用进行预测分析。结果 Hrp1蛋白原子总数2 166,等电点4.96,不稳定性指数19.62,脂肪族氨基酸指数100.35,平均疏水性0.042,有跨膜区无信号肽,1个糖基化位点6个磷酸化位点,二级结构以α-螺旋为主。其亚细胞定位于细胞质,属于稳定的亲水性蛋白。经预测,Hrp1蛋白含有4个B细胞表位,多个T细胞表位,且其相互作用蛋白分别为Rv2627c、 Rv2628、Rv1738、devR、Rv2624c、TB31.7、rip3、pfkB、guaA、hspX,并参与多种生物学过程。结论生物信息学分析Hrp1蛋白为稳定亲水性胞浆蛋白,具有良好的抗原表位,为结核病诊断及治疗的潜在候选因子,是探索结核分枝杆菌持久性感染机制的重要研究靶标,可作为抗结核多肽疫苗的候选蛋白。

• 单位
  西安交通大学城市学院; 石河子大学; 石河子大学医学院第一附属医院