马铃薯TCP基因家族全基因组鉴定与分析

作者：肖熙鸥; 林文秋; 冯雪峰; 高晓敏; 邹华芬; 李可; 金辉^*

来源：分子植物育种, 2018, 16(24): 7933-7938.

DOI：10.13271/j.mpb.016.007933

• 马铃薯(Solanum tuberosum)
• TCP转录因子
• 全基因组检索

TCP (Teosinte branched1/Cincinnata/proliferating cell factor)是植物特有的转录因子,在植物的生长发育过程中发挥着重要的作用。马铃薯(Solanum tuberosum L.)是世界范围重要的粮食作物,有着重要的价值。为研究马铃薯StTCPs基因家族子在马铃薯基因组中的数量与分布,本研究利用生物信息学方法,对马铃薯St TCPs家族成员进行全基因组鉴定,并且对其基因结构,染色体定位以及进化关系进行预测和分析。研究结果表明,马铃薯StTCPs家族共包含43个成员,可以分为ClassⅠ和ClassⅡ两类。染色体定位结果表明,马铃薯StTCPs不均匀地分布于11条染色体上,其中3号染色体分布的成员最多,包含10个家族成员。蛋白结构分析表明,StTCPs包含一个b-HLH结构域。本研究系统的分析了马铃薯StTCPs基因家族成员,为其后续功能的研究提供了良好的基础。

• 单位
  中国热带农业科学院南亚热带作物研究所; 农业部