烟草青枯菌FQY4基因组中原噬菌体生物信息学分析

作者:蔡刘体; 刘艳霞; 孟琳; 罗正友; 石俊雄
来源:中国烟草学报, 2015, 21(01): 82-88.
DOI:10.16472/j.chinatobacco.2013.505

摘要

为了解青枯菌(ralstonia solanacearum)基因组中原噬菌体和噬菌体元件的信息,在烟草青枯菌FQY4全基因组序列的基础上,分析了FQY4染色体上的原噬菌体,结果显示FQY4染色体上有1个具有完整噬菌体特征的原噬菌体,3个噬菌体元件。比较青枯菌GMI1000和FQY4中的原噬菌体的序列信息,结果显示它们具有一定的相似性,其中青枯菌FQY4的原噬菌体-2与噬菌体φRSA1的相似度为82%,它们有40个编码基因高度同源,相似度为99%以上。这些信息可为青枯菌原噬菌体的多样性分析,噬菌体和青枯菌的协同进化研究奠定基础。

  • 单位
    贵州省烟草科学研究院

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